우주세기 0079, 지구연방과 디온 공국이 싸운 한 해 전쟁의 말기.사이드 4인 스페이스 콜로니 군, 무어는 지온 군의 공격에 의해 파괴되어 많은 주민이 목숨을 잃었다.부서진 콜로니와 격침된 전함의 잔해가 무수히 떠도는 암초 주역에서는 서로 부딪쳐 대전한 데브리에 의해 끊임없이 번개가 번쩍이게 됐고 어느덧 그곳은 썬더볼트 주역이라 불리게 됐다.무어 시민의 생존자들로 구성된 지구연방군 소속 부대인 무어동포단은 고향인 선더볼트 주역의 탈환을 비원으로 주역의 지온군을 섬멸하려 하고 있었다.연방의 진군을 발이 묶이는 지온군도, 의지병의 전투 데이터 채취를 목적으로 설립된 리빙·데드 사단을 전개.무어 동포단에 소속되면서 고향이나 자신의 출신에 속박당하는 것을 역겨워하는 이오 플레밍과 과거 전투로 인해 두 다리를 잃고 지금은 리빙데드 사단에서 에이스 스나이퍼로 활약하고 있는 대릴 로렌츠는 전쟁터에서 대치할 때 서로 깨닫는 것이었다.두 사람은, 서로 죽이는 숙명인 것이라고……